| 樹種 | 名称 | 市町村 | 天然記念物指定 | NO |
|---|---|---|---|---|
| イチョウ | 専称寺の大イチョウ（山形市） | 山形市 | 市町村指定 | 102 |
| 楯の大銀杏（中山町） | 中山町 | 市町村指定 | 117 | |
| 向川寺の大イチョウ（大石田町） | 大石田町 | 県指定 | 59 | |
| 熊野神社の大イチョウ（南陽市） | 南陽市 | 県指定 | 24 | |
| 遍照寺の大イチョウ（長井市） | 長井市 | 市町村指定 | 54 | |
| 飛泉寺のイチョウ（小国町） | 小国町 | 市町村指定 | 91 | |
| 湯田川の乳イチョウ（鶴岡市） | 鶴岡市 | 県指定 | 23 | |
| 砂川の乳銀杏（旧朝日村） | 鶴岡市 | 市町村指定 | 104 | |
| 早田のオハツキイチョウ（旧温海町） | 鶴岡市 | 国指定 | 108 | |
| 三ヶ沢の乳イチョウ(旧立川町） | 庄内町 | 県指定 | 38 | |
| アカマツ | 田麦野のかさまつ（天童市） | 天童市 | 市町村指定 | 77 |
| 最上川伝承遺跡鍋掛松（中山町） | 中山町 | 66 | ||
| 臥龍のマツ(村山市） | 村山市 | 県指定 | 10 | |
| 本覚寺の左右マツ（村山市） | 村山市 | 県指定 枯死解除 | 12 | |
| 尾上の松（村山市） | 村山市 | 市町村指定 | 60 | |
| 東法田の大アカマツ(最上町） | 最上町 | 県指定 枯死解除 | 15 | |
| 念仏のマツ（舟形町） | 舟形町 | 市町村指定 | 45 | |
| 妹背の松（南陽市） | 南陽市 | 県指定 | 21 | |
| 千年松（高畠町） | 高畠町 | 市町村指定 | 92 | |
| 芦沢の千年マツ（長井市） | 長井市 | 市町村指定 | 82 | |
| 上伊佐沢のホーキマツ（長井市） | 長井市 | 市町村指定 | 141 | |
| 細野かぶと松（白鷹町） | 白鷹町 | 市町村指定 枯死解除 | 46 | |
| 伯楽の松（白鷹町） | 白鷹町 | 68 | ||
| クロマツ | 村上屋の念珠マツ（旧温海町） | 鶴岡市 | 県指定 | 34 |
| 払田の地蔵の松（旧余目町） | 庄内町 | 県指定 | 57 | |
| 舟つなぎの松（旧余目町） | 庄内町 | 市町村指定 | 119 | |
| ゴヨウマツ | 蔵王連峰随一の「天竜の松」（蔵王） | 山形市 | 63 | |
| 蟠龍のマツ（河北町） | 河北町 | 県指定 | 4 | |
| モミ | 白滝不動尊のモミ（旧朝日村） | 鶴岡市 | 市町村指定 | 69 |
| トラノオモミ（ハリモミ） | 西明寺のトラノオモミ（米沢市） | 米沢市 | 県指定 | 20 |
| ハリモミ | 永泉寺のハリモミ（遊佐町） | 遊佐町 | 県指定 | 126 |
| コウヤマキ | 龍護寺のコウヤマキ（尾花沢市） | 尾花沢市 | 市町村指定 | 81 |
| スギ | 津金沢のスギ（山形市） | 山形市 | 県指定 | 1 |
| 高沢の開山スギ（山形市） | 山形市 | 県指定 | 2 | |
| 臥龍山西常得寺の蟠形杉（天童市） | 天童市 | 市町村指定 | 122 | |
| 杉下大杉（山辺町） | 山辺町 | 市町村指定 | 52 | |
| 豊龍神社の大スギ（朝日町） | 朝日町 | 県指定 | 5 | |
| 松保の大スギ（大江町） | 大江町 | 県指定 | 7 | |
| 矢引沢大スギ（大江町） | 大江町 | 市町村指定 | 79 | |
| 頼義の杉（村山市） | 村山市 | 市町村指定 | 99 | |
| 三吉山の三吉スギ（村山市） | 村山市 | 市町村指定 | 121 | |
| おくまん様の大スギ(村山市） | 村山市 | 市町村指定 | 123 | |
| 延沢城址の大スギ(尾花沢） | 尾花沢市 | 県指定 | 13 | |
| 石動神社の親スギ（新庄市） | 新庄市 | 県指定 | 17 | |
| 角沢八幡神社のスギ（新庄市） | 新庄市 | 市町村指定 | 55 | |
| 大美輪の大杉（金山町） | 金山町 | 112 | ||
| 猿羽根楯跡の親杉（舟形町） | 舟形町 | 県指定 | 107 | |
| 滝ノ沢の一本杉（真室川町） | 真室川町 | 県指定／森の巨人100選 | 96 | |
| 熊野神社の大スギ（真室川町） | 真室川町 | 127 | ||
| 岩神大権現スギ（大蔵村） | 大蔵村 | 70 | ||
| 曲川の大杉（鮭川村） | 鮭川村 | 市町村指定 | 41 | |
| 角川の大スギ(戸沢村） | 戸沢村 | 県指定 | 33 | |
| 山ﾉ内黒すぎ（戸沢村） | 戸沢村 | 73 | ||
| 土湯杉の群生地（戸沢村） | 戸沢村 | 75 | ||
| 餅杉（南陽市） | 南陽市 | 市町村指定 | 98 | |
| 二本杉（南陽市） | 南陽市 | 市町村指定 | 110 | |
| 蘊安（ウンナン）神社のスギ（長井市） | 長井市 | 市町村指定 | 84 | |
| 岩切不動の門スギ（長井市） | 長井市 | 市町村指定 | 113 | |
| 葉山神社のスギ（長井市） | 長井市 | 市町村指定 | 124 | |
| 六斗沢のスギ（小国町） | 小国町 | 市町村指定 | 116 | |
| 羽黒神社の大杉（白鷹町） | 白鷹町 | 市町村指定 | 65 | |
| 諏訪神社の千年杉（白鷹町） | 白鷹町 | 市町村指定 | 88 | |
| 尾幡山の大スギ（飯豊町） | 飯豊町 | 136 | ||
| 羽黒山のスギ並木（羽黒町） | 鶴岡市 | 国指定 | 25 | |
| 熊野神社の大スギ（鶴岡市） | 鶴岡市 | 国指定 | 30 | |
| 山五十川の玉スギ（旧温海町） | 鶴岡市 | 国指定 | 31 | |
| 添川の根子スギ（旧藤島町） | 鶴岡市 | 県指定 | 40 | |
| 皇壇スギ（旧朝日村） | 鶴岡市 | 県指定 | 86 | |
| 羽黒山の爺杉（旧羽黒町） | 鶴岡市 | 国指定 | 100 | |
| 勝地の大杉（旧櫛引町） | 鶴岡市 | 市町村指定 | 120 | |
| 総光寺参道のキノコスギ(旧松山町） | 酒田市 | 県指定 | 22 | |
| 小林不動杉（旧平田町） | 酒田市 | 市町村指定 | 62 | |
| 小野曽の千本杉（遊佐町） | 遊佐町 | 市町村指定 | 114 | |
| クロベ | 岩神権現のクロベ（大蔵村） | 大蔵村 | 市町村指定／森の巨人100選 | 83 |
| 上倉山のクロベ（朝日町） | 朝日町 | 森の巨人100選 | 138 | |
| 十文字開発記念樹（旧藤島町） | 鶴岡市 | 県指定 | 48 | |
| ヒバ（アスナロ） | 道満の三光ヒバ（天童市） | 天童市 | 市町村指定 | 56 |
| イチイ | 長龍寺のイチイ（上山市） | 上山市 | 市町村指定 | 137 |
| カヤ | 神代カヤ(大江町） | 大江町 | 県指定 | 6 |
| 市立図書館のカヤノキ（新庄市） | 新庄市 | 市町村指定 | 51 |
